区块链神吐槽孟德尔做了八年琐碎无聊无趣的豌豆实验，是因为他相信，豌豆性状的变化与生物波澜壮阔的进化之间具有内在关联，揭开豌豆的秘密，就能一窥进化的本质。
通过豌豆实验，孟德尔总结出两项定律和一项原则。
显性和隐性原则
第一定律：分离定律
第二定律：自由组合定律
据说萧伯纳曾拒绝了一位美丽贵妇提出的合作生娃的建议，因为他担心孩子将会继承他的丑陋和贵妇的愚蠢。
不妨让我们假设，美丽和聪明是显性的，丑陋和愚蠢则是隐性的。并且它们位于两对同源染色体上，由单基因控制。染色体Aa（美丽||丑陋）；染色体Bb（聪明||愚蠢）。
不妨让我们继续假设萧伯纳是aaBb，贵妇是Aabb。（显性基因很少有纯合的，所以这样假设是合理的）
那么他们的娃中将有一半是聪明的，有一半是美丽的。但你不能简单的说，他们的娃要么是聪明的要么是美丽的，事实上有1/4（1/2*1/2）的娃将是即蠢又丑的。这就是分离定律和自由组合定律所得到的结果。
即聪明又美丽的娃的基因型当然是AaBb，假如发生了德国骨科事件，得到即蠢又丑的娃概率现在就不再是1/4，而是降低到了1/16（1/4*1/4），得到即聪明又美丽的娃的概率则是9/16。是的，也就将将超过一半而已，父母都聪明漂亮，在这种设定下也只有大约一半的孩子能继承这样的优点。（经典9:3:3:1）
看来萧伯纳的悲观，的确有他的道理。
顺便提一句，从古典遗传学家开始，许多遗传学家相信，有性生殖的好处就是得到比如——aabb（既愚蠢又丑陋）这样的替罪羊个体。生物能通过有性生殖方式，将不可避免必然产生的有害突变，集中到单个后代个体身上去，将它献祭给自然选择，从繁衍清单上开除出局，能够维持物种基因库的健康度。遗传学的结论未必让人舒服，因为大自然的运转模式从不考虑人的心情。
孟德尔研究了豌豆的七种性状，这七种性状都很好的满足了分离定律和自由组合定律，尤其是在经典的AdBb的自交实验中，出现了9:3:3:1这样的极有说服力的比例。
而后世又发现豌豆恰好有七对染色体，所以很多人说，孟德尔真是好运到爆。他选择了豌豆最醒目的七个性状进行遗传学研究，而豌豆就恰好具有七对染色体，从而总结出他的一个原则两个定律，岂非天意乎。
其实，这些感叹的人不知道，孟德尔的确运气不错，甚至超过他们感叹的好，因为实际上这七个性状并不真的恰好位于七条染色体上，决定豆荚颜色（绿和黄）和豆子的圆与皱的基因，位于同一条染色体上，那为什么所有两两性状的组合，在计算时都符合9:3:3:1的比例呢？
那是因为，这两个基因相隔遥远，所以总能在同源染色体配对发生重组时，将这两个基因分离的缘故，因此它们将表现得像是位于不同的染色体上，从而实现自由组合的结果。摩尔根实验室用果蝇作为模式生物，建立起了完整的经典遗传学大厦，而基因连锁互换现象，引导出的关键推论则是——基因必然在染色体上线性排列。
遗传学家利用这一现象，开始制作不同物种的遗传图谱（连锁图谱），在基因测序技术出现之前，遗传学家就能用这一即复杂又高超的技术，通过复杂的遗传实验设计，不断逼近特定基因在染色体上的大概位置。属于前辈神技的一种。
事实上，染色体的数量远少于基因的数量，因此性状之间的连锁遗传现象是必然出现的，比如人类遗传病中的伴性遗传病就是这样的，由于导致疾病出现的基因位于性染色体上，因此疾病的出现和性别连锁，比如Y染色体上的疾病自然只能从父亲传递给儿子，而X染色体上的疾病，如果是父亲的，则只会传给女儿，不会传给儿子。
不过，对孟德尔的实验结果，后世争论最大的是，他的实验结果太好了，好得不像是真的，1936年著名统计学家fisher指控孟德尔操纵实验数据，不过首先在孟德尔时代，并没有真正的统计学，因此主观操纵是没有的，但是不是在实验初期孟德尔发现了大约3:1的比例后，刻意收集更多数据，直到它符合他心中满意的数据时为止，这事情很难说清楚。
但是，类似3:1的比例，其实在孟德尔同代人的其它遗传学实验中也能见到，只不过唯有孟德尔抓住了这一点，构建出了他的遗传学王国，并通过组合相关的遗传实验来进一步论证和推进他的理论。从这一点上说，孟德尔的实验思想是相当超前的，许多人做实验就是随便做然后观察观察就算完事。
而孟德尔不知不觉间将假说演绎法引入遗传学研究中，这种研究方法，最终在摩尔根实验室找到知音，年轻的遗传学家缪勒，极力提倡孟德尔式研究方法，即应该在有明确的假说指导下去设计遗传学实验，实验的结果要么能证实假说要么能否证假说。
而经由缪勒（侥幸从斯大林铁腕下逃脱性命的美国白左，长期被FBI监控）的大力提倡，如今在遗传学实验以及许多相关衍生学科中，假说演绎法实验设计已经成为标书的标准格式。
这种方法要说有什么弊端，就是伪造数据，强行证明假说是正确的。
